建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此,疾病模型研究結(jié)果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來就讓上海研錄帶您了解相關(guān)知識。一個好的疾病模型應(yīng)具有以下特點:①能夠再現(xiàn)所要研究的人類疾病,動物疾病表現(xiàn)應(yīng)該與人類疾病相似;②動物能重復(fù)產(chǎn)生該疾病,盡可能能在兩種動物體內(nèi)復(fù)制該?。虎蹌游锉尘百Y料完整,實驗動物合格,生命周期要滿足實驗需要;④動物要價廉、來源充足、便于運送;⑤盡可能選用小動物。生物醫(yī)學(xué)科研專業(yè)設(shè)計中常要考慮如何建立動物模型的問題,因為很多闡明疾病及療效機制的實驗不可能或不應(yīng)該在患者身上進行。常要依賴于復(fù)制動物模型,但一定要進行周密設(shè)計,設(shè)計時要遵循下列一些原則:(一)相似性在動物身上復(fù)制人類疾病模型,目的在于從中找出可以推演應(yīng)用于患者的有關(guān)規(guī)律。外推法(extrapolation)要冒風(fēng)險,因為動物與人到底不是一種生物。如,在動物身上無效的藥物不等于臨床無效,反之亦然。因此,設(shè)計動物疾病模型的一個重要原則是,所復(fù)制的模型應(yīng)盡可能近似于人類疾病的情況。能夠找到與人類疾病相同的動物自發(fā)性疾病當(dāng)然是比較好的。(二)重復(fù)性理想的動物模型應(yīng)該是可重復(fù)的,甚至是可以標準化的。如??蒲行“兹绾蚊髯约旱念A(yù)實驗。云南科研技術(shù)服務(wù)實驗室
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。貴州實驗科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)實驗干貨 | 分子克隆實驗——無縫克隆。
靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會等上層膠凝2個小時再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個小時的時候沿著梳子上緣加點電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強電場了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬?,然后觀察泳道內(nèi)有無脫落的膠?;蛘吣z絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會開始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時候沒有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來,不然樣品中SDS可能會結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準備我會在電泳結(jié)束0分鐘準備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準備轉(zhuǎn)膜裝置。
是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關(guān),揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個途徑:精細調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。維持細胞內(nèi)外環(huán)境的穩(wěn)定。細胞質(zhì)是細胞內(nèi)的液體,其中包含了各種細胞器和細胞骨架等結(jié)構(gòu)。
應(yīng)退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應(yīng)盡量保持無水,應(yīng)經(jīng)常更換,或用紗布包無水硫酸銅放入染色缸內(nèi)吸收水分。5.透蠟注意事項(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內(nèi)部達到飽和程度以便包埋。透蠟時間根據(jù)組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時間內(nèi)完成石蠟透入過程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(1)染色原理:伊紅主要染細胞質(zhì),著色濃淡應(yīng)與蘇木精染細胞核的濃淡相配合,如果細胞核染色較濃,細胞質(zhì)也應(yīng)濃染,以獲得鮮明的對比。(2)染色時間應(yīng)根據(jù)染色劑的成熟程度及室溫高低,適當(dāng)縮短或延長。室溫高時促進染色,染色時間可短些,否則可適當(dāng)延長時間,冬季室溫低時可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過大,以防切片脫落。(4)如果細胞核染色較淺,細胞質(zhì)也應(yīng)淡染??稍谝良t乙醇液中滴加數(shù)滴冰醋酸助染,促使細胞質(zhì)容易著色,并且經(jīng)乙醇脫水時不易褪色。進行免疫沉淀法時,抗體需要和一個受質(zhì)結(jié)合。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗
常用于研究細胞的成瘤能力、細胞的轉(zhuǎn)移、細胞的耐藥和靶分子對腫瘤細胞的發(fā)展的影響等等。云南科研技術(shù)服務(wù)實驗室
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應(yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。云南科研技術(shù)服務(wù)實驗室